康复医学科在综合医院医疗过程中作用非常独特，但地位尴尬。我国目前拥有早期康复介入能力的康复科主要集中在部分大医院，20%的省级综合医院、30%的市级综合医院和56%的市级以下医院不具备早期康复能力，仍以提供传统康复服务为主。康复科的地位尴尬表现在：
　　一是康复医学科的规模太小。解决临床疑难、重症的疾病的康复问题，有足够数量康复医学的床位是一个必要条件。然而，目前达到《综合医院康复科基本标准》规定的“康复床位要占到三级综合医院床位的3%~5%”的医院，比例很低。
　　二是综合医院内部康复流程不科学。康复医学科与临床科室如何对接？由于康复医学是一个相对较新的学科，与其他专业医务人员和患者沟通不够。同时，大多数临床医生没有经过康复医学基本知识的普及，所以康复医学专业在综合医院中要特别重视宣传工作，使大多数医务人员知道康复医学在整个医疗过程中发挥的作用，使临床治疗科室和康复科室紧密合作。但只进行宣传也是不够的，还要有制度和措施作保证。
　　三是康复患者的出口问题。由于很多康复患者在短期内不能完全康复，同时又不能在综合医院住院时间过长。只有为康复患者找到合适的“出口”，才能使患者顺畅地流动。目前国家倡导的三级康复医疗体系为解决这个问题提供了依据，即提倡在大型综合医院附近建立康复医院并帮助社区服务中心建立康复服务，形成区域网络，持续地对患者进行康复服务。综合医院需要有康复医院承接转诊的患者，而出现病情变化康复患者还可以转回综合医院进行必要的处置。通过建立分层级、分阶段的康复医疗服务体系，逐步实现患者在综合医院与康复医院、基层医疗卫生机构间的分级医疗、双向转诊。
　　另外，综合医院在开展康复医学的工作中，还要防止另一种倾向，即临床上游治疗科室一哄而上搞康复的倾向。康复医学是一门专业性很强的学科，工作模式是在经过正规培训的康复医生指导并带领多专业的团队（包括语言治疗师、心理治疗师等）对患者进行全面评估和综合康复后形成的，并不是用某些单一技术对患者进行的康复，因为这样做最终会损害患者的利益，反而影响整个医院的医疗质量，同时也会造成科室之间工作范围的冲突。