解放军第八六医院注重内涵式发展，围绕管理创新，技术创新，不断加强精细化、规范化、标准化建设，对新型高素质人才的需求也日益增大。近年来，医院在与南京军区总医院、第81医院、第454医院建立牢固技术帮带基础上，又坚持走军民结合、寓军于民的发展之路，先后与地方南方医院、协和医院、江苏省人民医院、南京第一医院、安医大、皖南医学院、安徽中医院等高校和知名医院建立了交流合作机制。他们充分发挥各自优势，互相支持、资源共享，在人才培养、学科建设、教学科研等领域进行全方位合作，先后建立了心血管介入治疗中心、肿瘤中心、放疗中心、健康管理中心等学科，有力地提升了医院的发展质量和水平，取得丰硕成果惠及广大军民。同时，八六医院还发挥自身技术优势，帮扶驻地乡镇卫生院发展，与当涂县太白卫生院、马鞍山市博望区卫生院建立挂钩帮带关系，培养乡镇卫生院骨干，有力地支持了驻地乡镇卫生院的发展。